リーゾ研究部の実験ノート

(株)リーゾ 研究部でこれは使えるかも、と思われた”ちょっとした工夫”を実験ノートにまとめてみました。

なるべくお金をかけずに実験が可能になるよう工夫しました。

      皆さまのお役にたてれば幸いです。      リーゾ 研究部スタッフ

                                  リーゾへはこちら

核酸抽出 DNA RNA カラム 試薬 フェノール クロロホルム PCR

コメント

ibaraki様、コメントありがとうございます。
(お返事が大変遅くなり申し訳ありません)

個体群内変異のSNPsと亜種間変異のSNPsが混在する遺伝子領域であっても、
目的のSNPs自体が亜種間変異として安定しているのであれば、
亜種の識別用マーカーとして利用することができます。
 
個体群内変異のSNPsが、プライマー設計部位にかかってしまう場合には注意が必要ですが、
経験上、プライマー上に別の動きをするSNPsがあっても、問題になることはあまりありません。
 
お役に立つマーカーが作れると思いますので、ぜひ一度お試しください。
ご検討よろしくお願いいたします。

すにっぷすいすいに興味があります。
亜種の識別に使っている例をブログで見ました。
あの例では、SNP以外のサイトは亜種間で保存されていましたが、
個体群内変異のSNPと亜種間変異のSNPがごちゃごちゃに存在する
遺伝子領域でも、亜種の識別をすることはできるのでしょうか。

この記事へのコメントは終了しました。